2006年10月，云南省教育厅、云南省学位委员会组织我省高校进行了云南省“十一五”省级重点学科建设项目的申报。云南省教育厅、云南省学位委员会组织相关专家对照遴选条件进行评审推荐，最终遴选并批准了10个一类重点学科和33个二类重点学科进行立项建设。因我院目前尚无博士学位授权点，故一类重点学科申报未获得成功，而“民族医学”和“中西医结合基础”两个学科因在同类学科中有特色和优势，并有较好的成长性，能紧密结合云南的优势产业、新兴产业和高技术产业以及社会发展需要，能带动或促进校内其他学科共同发展，获得二类省级重点学科立项建设。